这并不奇怪，已与许多胃肠道疾病消化不良。然而，也有许多非胃肠道疾病与消化不良。后者的例子包括 糖尿病，甲状腺疾病，甲状旁腺功能亢进（甲状旁腺过度活跃），严重的肾脏疾病。目前尚不清楚，但是，如何将这些非胃肠道疾病可能引起消化不良。消化不良的第二个重要原因是药品。事实证明，许多药物被经常伴有消化不良，例如， 非甾体类抗炎药（非甾体抗炎药如布洛芬），抗生素，和雌激素）。事实上，大多数药物报告至少在某些患者中引起消化不良。

 

正如前面所讨论的，大多数性消化不良（不是由于非胃肠道疾病或药物），被认为是由于对胃肠道的器官或器官的神经控制的肌肉功能异常。胃肠道的神经控制的，但是，是复杂的。神经运行的系统，从食道到肛门的肌肉壁的器官的胃肠道的整个长度上。这些神经沟通与其他的旅游和脊髓的神经。脊髓内的神经，反过来，到和从大脑。（胃肠道超过它仅包含由脊髓和大脑中的神经数）因此，消化不良的神经系统功能异常，则可能会出现在胃肠道的肌肉器官，脊髓或脑。

 

控制胃肠器官的神经系统，与大多数其他器官，包含感觉神经和运动神经。连续的感觉神经的感觉发生了什么（活动）内的器官和传递信息，神经器官的墙。从这里，信息可以传递到脊髓和大脑。信息被接收和处理的器官的壁中，脊髓或大脑。然后，基于该感觉输入和处理输入的方式，命令（响应）发送到在运动神经器官。在肠道中的较常见的运动反应两个进入器官的器官和分泌的流体和/或粘液的肌肉收缩或松弛。

 

正如已经提到的，功能异常的胃肠器官的神经，至少在理论上，可能会发生在器官，脊髓或脑。此外，异常，可能会发生在感觉神经，运动神经，或在肠道内，脊髓或脑的处理中心。

 

一些研究人员认为，功能疾病的原因是在感觉神经功能的异常。例如，正常的活动，如伸展的小肠的食物，可能会引起感官信号发送到脊髓和大脑，在那里他们被视为痛苦。其他的研究人员认为，功能疾病的原因是在运动神经功能的异常。例如，通过运动神经异常命令可能会产生痛苦的肌肉痉挛（收缩）。还有一些人认为，功能异常处理中心负责对功能性的疾病，因为他们误解了正常的感觉，或发送异常命令的器官。事实上，一些功能性的疾病可能是由于感觉障碍，运动功能障碍，或感觉和运动功能障碍。其他可能是由于异常内的加工中心。

 

这些功能性疾病的几个潜在的机制（原因）相关的一个重要概念是“内脏过敏症”的概念。这个概念疾病，影响胃肠器官（内脏）指出，“敏”（改变的响应）的感觉神经或处理中心，从器官的感觉。根据这一理论，一种疾病，如 溃疡性结肠炎（结肠的炎症）可以造成*性变化的灵敏度的神经或加工中心的结肠。作为一个结果，该先有炎症，正常的刺激被认为（毡）为异常（例如，作为疼痛）。因此，正常结肠的收缩可能是痛苦的。目前还不清楚是什么，前疾病可能导致过敏症的人，虽然对胃肠道的感染性疾病（细菌或病毒）是较经常提到的。内脏高敏感性已经清楚地表明，在动物和人。及其作用的共同功能的疾病，然而，目前还不清楚。

 

虽然尚未确定的频率，这种情况会导致消化不良，消化不良的另一个潜在原因的小肠细菌过度生长（小肠细菌过度生长或SIBO），并在该地区很少有研究。过度生长之间的关系和消化不良需要要追求的，然而，由于许多消化不良的症状也细菌繁茂症状。过度生长氢呼气试验可以诊断和治疗用抗生素。

 

其他疾病和条件，可加重功能性的疾病，包括消化不良。焦虑和/或抑郁症可能是较普遍*的不利因素与功能性疾病的患者。另一加重因素是月经周期。在他们的期间，女性常会注意到，他们的功能性症状加重。这对应的时间，在此期间，其中，雌激素，雌激素和孕激素，是在其较高水平的。此外，已经观察到，在减少在绝经前妇女的消化不良的症状是有效的治疗妇女有消化不良 ），可注射的药物，切断体内的雌激素和孕激素的生产，醋酸亮丙瑞林（Lupron。这些观察结果支持功能性症状的加剧激素的作用。